Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms