Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms