Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 UST-AS1-201ENST00000413845 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078883.3-202ENST00000417539 754 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT223P-201ENST00000422957 519 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4D8P-201ENST00000431137 930 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02006-203ENST00000493214 812 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC90B-211ENST00000529073 719 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRHDE-AS1-204ENST00000550334 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF527-204ENST00000587349 999 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031587.3-201ENST00000609976 814 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000851.2-201ENST00000629499 721 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006453.2-201ENST00000636531 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FSHB-201ENST00000254122 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 BMP15-201ENST00000252677 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBD-203ENST00000377050 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFPL3-202ENST00000397468 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms