Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms