Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms