Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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