Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms