Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms