Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YME1L1Q96TA2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YME1L1Q96TA2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms