Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCNX1Q96RV3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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