Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms