Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms