Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85AQ96PX6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms