Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF48Q96MX3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms