Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YTHDC1Q96MU7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms