Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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