Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms