Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC34Q96HJ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms