Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms