Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC47Q96A33 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CCDC47Q96A33 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CCDC47Q96A33 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC47Q96A33 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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