Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCE1Q969G3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms