Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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