Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms