Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF4Q8WXU2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms