Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF4Q8WV16 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms