Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3LQ8TDB6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3LQ8TDB6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms