Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms