Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATL2Q8NHH9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATL2Q8NHH9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATL2Q8NHH9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATL2Q8NHH9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATL2Q8NHH9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATL2Q8NHH9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms