Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms