Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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