Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms