Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC24Q8N4L8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms