Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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