Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNTD2Q8IXW0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms