Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX29P2Q8IUI4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms