Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CATSPER4Q7RTX7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CATSPER4Q7RTX7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms