Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf89Q6UWU4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf89Q6UWU4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms