Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms