Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms