Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFCAB12Q6NXP0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms