Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN13Q6MZZ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN13Q6MZZ7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN13Q6MZZ7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPN13Q6MZZ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN13Q6MZZ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms