Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms