Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms