Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC158Q5M9N0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms