Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms