Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47AQ5JRC9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms