Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms