Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYDC2Q56P42 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms