Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms