Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms